Traitement rapide des données moléculaires avec le Raspberry Pi

Effets declairage autonomes utilisant un Raspberry Pi Zero and Go
Effets declairage autonomes utilisant un Raspberry Pi Zero and Go

Je ne peux pas prétendre savoir exactement de quoi parle Matt Williams dans son article, mais il suffit de dire qu’il fait quelque chose de très impressionnant avec son Pi. Je vais le laisser expliquer:

L’appariement de substances de sous-structures est, à bien des égards, un exercice non trivial en Cheminformatique. La quantité de données utilisées pour déterminer les correspondances augmente très rapidement. Par exemple, une méthode pour décrire «l’empreinte» d’une molécule utilise 880 octets. Ou 2 ^ 880 combinaisons. Cet espace est très peu peuplé, mais il existe encore de nombreuses combinaisons potentielles.

Si vous êtes toujours avec moi, dans son article, il explique comment le Pi fait la correspondance de motifs avec grep et comment il accélère lors de la lecture à partir du cache. Lisez son article ici.